inheritance-algorithm
L'algorithme d'héritage est un programme en ligne de commande écrit en Python qui permet d'attribuer à chaque groupe clonal (CG) un identifiant qui reflète le plus possible l'identifiant ST à 7 gènes des isolats correspondants. Cet algorithme utilise un ensemble de règles de dénomination qui priorisent l'ST le plus abondant observé parmi les isolats de chaque CG, ainsi que des règles supplémentaires en cas d'égalité.
Cas d'utilisation métiers
- Attribution de identifiants à des groupes clonaux (CG) en fonction de leur profil génétique : rechercher des initiatives proches
- Correspondance entre les identifiants existants et les nouveaux identifiants générés : rechercher des initiatives proches
- Création d'une nomenclature pour les souches bactériennes basée sur leur profil génétique : rechercher des initiatives proches
Organisation
- Ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Espace (organisation rattachée)
Description générée le mardi 19 mars 2024 à 15:23:56
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