DemoSEQ

DemoSEQ est un ensemble d'outils en Python 2.7 permettant de calculer des statistiques de résumé pour des données de séquençage de génomes entiers. Ces statistiques peuvent être utilisées pour inférer l'histoire démographique de populations à partir de ces données. Le projet contient des scripts pour calculer des statistiques telles que l'hétérozygotie attendue, la D de Tajima, la proportion de sites segregants, la diversité haplotypique moyenne sur 50 kb, le spectre de fréquence des sites, la liaison déséquilibrée et la longueur des tracts identiques par état.
Description générée le mardi 19 mars 2024 à 15:14:57

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