srp-pipeline
Notoriété 18 %
Ce projet est un pipeline d'analyse utilisant Snakemake pour le profilage d'ARN à l'aide de la séquençage 3'. Le pipeline prend en entrée un tableau décrivant vos échantillons, une ou plusieurs paires de fichiers fastq et éventuellement un fichier listant les comparaisons à tester.
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
- Analyse de profilage d'ARN à l'aide de la séquençage 3' : rechercher des initiatives proches
- Analyse différentielle de gènes exprimés : rechercher des initiatives proches
- Alignement de séquences sur le génome de référence : rechercher des initiatives proches
- Démultiplexage d'échantillons : rechercher des initiatives proches
Organisation
- Nantes Université (organisation rattachée)
Description générée le mardi 19 mars 2024 à 14:39:47
D'autres initiatives de la même organisation
- Nantes Universitéuniv-nantes.fr
- Développement Orienté Objetsgitlab.univ-nantes.fr/iut.info1.dev.objets/dev.objets.ressources
- Qualité de développement : design patternsgitlab.univ-nantes.fr/iut.info2.qdev.dp/qdev.dp.ressources
- r3_06.cmgitlab.univ-nantes.fr/iut.info2.r3_06/r3_06.cm