gatb-minia

Minia est un assembleur de génomes basé sur un graphe de de Bruijn, capable d'assembler un génome humain sur un ordinateur de bureau en un jour. Il produit un ensemble de contigs à partir de lectures courtes. Minia a été initialement publié en 2012 et a produit des résultats de similarité et d'exactitude comparables à d'autres assembleurs de de Bruijn (par exemple, Velvet). Cependant, les assembleurs de génomes ont évolué et, pour obtenir une grande contiguïté, il est recommandé d'utiliser le pipeline gatb-minia-pipeline.
Description générée le lundi 18 mars 2024 à 22:37:44

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