beginning_obitools
Beginning_obitools est un projet composé d'une collection de commandes Python conçues pour analyser les données eDNA métabarcoding à l'aide de séquenceurs Illumina. Il suit le tutoriel d'OBITools et permet de créer des paires de lectures, d'effectuer un filtrage, de démultiplexer les séquences et de les dédoublonner.
Cas d'utilisation métiers
- Assignation de séquences à des PCR initiales : rechercher des initiatives proches
- Reconstruction de séquences à partir de lectures : rechercher des initiatives proches
- Analyse de données eDNA métabarcoding : rechercher des initiatives proches
- Utilisation de séquenceurs Illumina : rechercher des initiatives proches
Organisation
- Centre national de la recherche scientifique (organisation rattachée)
Description générée le mardi 19 mars 2024 à 19:51:14
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