snakemake_stacks2

Ce projet utilise un workflow de gestion de pipeline Snakemake pour traiter les données RADseq provenant du projet RESERVEBENEFIT. Il inclut des scripts pour l'alignement des séquences, le filtrage des clones et l'analyse des populations à l'aide de STACKS 2.2, BWA 0.7.17 et SAMTOOLS 1.9.

Dépôt de code

https://gitlab.mbb.cnrs.fr/reservebenefit/snakemake_stacks2 (nouvelle fenêtre)

Cas d'utilisation métiers

Analyse de données issues de la séquence d'ADN : rechercher des initiatives proches
Génération de données pour la recherche en génomique : rechercher des initiatives proches

Organisation

Administration centrale
- Gouvernement (Premier ministre et ministères)
  - Ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Espace
    - Établissements publics sous tutelle - Ministère chargé de l'Enseignement supérieur
      - Centre national de la recherche scientifique (organisation rattachée)

Description générée le lundi 18 mars 2024 à 23:58:17

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