atac-pipeline
Notoriété 7 %
Ce pipeline snakemake permet le traitement de données ATAC-seq en vue de l'analyse de régions fonctionnelles dans le génome. Il comprend des étapes de contrôle qualité, d'alignement sur le génome de référence, de filtrage des séquences, d'appel de pics et de visualisation sur le navigateur UCSC.
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
- Analyse de données ATAC-seq : rechercher des initiatives proches
- Visualisation des données sur le navigateur UCSC : rechercher des initiatives proches
- Appel de pics pour l'identification de régions fonctionnelles : rechercher des initiatives proches
- Alignement et filtrage de séquences : rechercher des initiatives proches
Organisation
- Nantes Université (organisation rattachée)
Description générée le lundi 18 mars 2024 à 00:40:43
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