tardigrade_scaffolding
Ce projet vise à améliorer l'assemblage du génome du tardigrade Paramacrobiotus fairbanski, une espèce à reproduction parthénogénétique. Il utilise des données de séquençage nanopore et des contacts HiC pour reconstruire des scaffolds plus longs et cohérents. Plusieurs outils comme YAHS, GreenHill ou AutoHiC sont testés pour optimiser la structure chromosomique et réduire les fragments résiduels.
Cas d'utilisation métiers
- Phasage d'haplotypes : rechercher des initiatives proches
- Scaffolding de génomes polyploïdes : rechercher des initiatives proches
- Analyse de données HiC : rechercher des initiatives proches
- Amélioration d'assemblages génomiques : rechercher des initiatives proches
- Correction de reads nanopore : rechercher des initiatives proches
Description générée le jeudi 12 novembre 2026 à 16:21:19