Custom Metabarcoding Reference Database

MKBDR est un programme python conçu pour créer des bases de données de référence personnalisées à partir de fichiers FASTA en utilisant la nomenclature taxonomique NCBI. Il fournit également des outils pour aider et faciliter la curation taxonomique sur le fichier FASTA d'entrée.

Dépôt de code

https://gitlab.mbb.cnrs.fr/edna/custom_reference_database (nouvelle fenêtre)

Cas d'utilisation métiers

Assistance à la curation taxonomique : rechercher des initiatives proches
Téléchargement de la nomenclature NCBI taxonomy : rechercher des initiatives proches
Aide à la création de base de données de référence pour le métabarcodage : rechercher des initiatives proches

Organisation

Administration centrale
- Gouvernement (Premier ministre et ministères)
  - Ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Espace
    - Établissements publics sous tutelle - Ministère chargé de l'Enseignement supérieur
      - Centre national de la recherche scientifique (organisation rattachée)

Outil utilisé

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Description générée le mardi 19 mars 2024 à 09:33:31

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