SWANI
SWANI est un outil en ligne de commande conçu pour estimer avec précision les mesures de similarité ou de dissimilarité entre paires de séquences génomiques non alignées. Il implémente l'approche OrthoANI en utilisant l'algorithme de Smith-Waterman pour fournir des évaluations fiables de l'identité nucléotidique moyenne (ANI) et des distances p entre génomes. Idéal pour les chercheurs en bioinformatique et en génomique, il permet de comparer des génomes bactériens ou viraux afin d'identifier des relations évolutives ou des variations génétiques.
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
- Analyse de séquences génomiques : rechercher des initiatives proches
- Calcul de similarité entre génomes : rechercher des initiatives proches
- Évaluation de distances évolutives : rechercher des initiatives proches
- Estimation de l'identité nucléotidique moyenne : rechercher des initiatives proches
- Comparaison de paires de génomes : rechercher des initiatives proches
Description générée le jeudi 12 novembre 2026 à 19:46:10