eCDS

ECDS est un outil en ligne de commande écrit en Bash permettant d'extraire des séquences codantes (CDS) à partir d'un fichier FASTA de séquences nucléotidiques en utilisant une requête de séquence protéique ou une matrice de score position spécifique.

Dépôt de code

https://gitlab.pasteur.fr/GIPhy/eCDS (nouvelle fenêtre)

Cas d'utilisation métiers

Recherche de similarités entre séquences nucléotidiques et protéiques : rechercher des initiatives proches
Extraction de séquences codantes à partir de fichiers FASTA : rechercher des initiatives proches

Cas d'utilisation fonctionnel

Possède un système de recherche : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi

Organisation

Administration centrale
- Gouvernement (Premier ministre et ministères)
  - Ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Espace (organisation rattachée)

Outil utilisé

GNU Bash : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi

Description générée le mardi 19 mars 2024 à 08:47:10

D'autres initiatives de la même organisation

#dataESR
data.esr.gouv.fr
French Open Science Monitor
frenchopensciencemonitor.esr.gouv.fr
CurieXplore
curiexplore.enseignementsup-recherche.gouv.fr
Works-magnet
works-magnet.esr.gouv.fr