menetools
MeneTools est un ensemble d'outils Python permettant d'explorer le potentiel de producibilité dans un réseau métabolique à l'aide de l'algorithme d'expansion de réseau. Les outils MeneTools peuvent évaluer si des cibles sont producibles à partir de nutriments, identifier tous les composés producibles à partir de nutriments, identifier toutes les réactions activables à partir de nutriments, obtenir des chemins de production pour des composés spécifiques, identifier des métabolites qui, s'ils étaient ajoutés aux nutriments, garantiraient la producibilité des cibles, identifier des points morts dans les réseaux métaboliques et identifier des composés échangés dans les réseaux métaboliques.
Cas d'utilisation métiers
- Analyse de points morts dans les réseaux métaboliques : rechercher des initiatives proches
- Analyse de voies métaboliques : rechercher des initiatives proches
- Analyse de réseaux métaboliques : rechercher des initiatives proches
- Identification de métabolites producibles : rechercher des initiatives proches
- Identification de cofacteurs : rechercher des initiatives proches
Cas d'utilisation fonctionnel
Organisation
- Institut national de recherche en informatique et en automatique (organisation rattachée)
Description générée le mardi 19 mars 2024 à 09:33:48