cycleassembler
Pipeline itératif d'assemblage génomique conçu pour étendre des contigs initiaux à partir de lectures Illumina et de séquences de référence. Il permet de reconstruire des génomes plastidiens, des gènes histones ou des gènes cibles à partir de données de séquençage à faible couverture. Le processus utilise des cycles d'alignement, d'extraction et d'assemblage pour améliorer progressivement les contigs jusqu'à obtenir des séquences optimales.
Cas d'utilisation métiers
- Extension de contigs de référence : rechercher des initiatives proches
- Traitement de séquences génomiques : rechercher des initiatives proches
- Assemblage de génomes plastidiens : rechercher des initiatives proches
- Reconstruction de gènes histones : rechercher des initiatives proches
- Analyse de données génomiques : rechercher des initiatives proches
Cas d'utilisation fonctionnel
Outil utilisé
Description générée le jeudi 12 novembre 2026 à 19:11:56