rnaflow
Notoriété 15 %
RNAflow est un pipeline snakemake dédié à l'analyse transcriptomique standard. Il permet le traitement de données RNA-seq en utilisant différents outils de bioinformatique tels que cutadapt, alienTrimmer, fastqc, sortmeRNA, samtools, bowtie2, bedtools, star, minimap2, kallisto, salmon, subread, deeptools et multiqc.
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
- Utilisation de différents outils de bioinformatique pour le traitement des données RNA-seq : rechercher des initiatives proches
- Utilisation de l'outil snakemake pour la gestion des workflows : rechercher des initiatives proches
- Analyse de données RNA-seq : rechercher des initiatives proches
- Analyse de données transcriptomiques standard : rechercher des initiatives proches
Organisation
- Ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Espace (organisation rattachée)
Description générée le dimanche 17 mars 2024 à 23:51:19
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