metabarcoding_data_simulations
Ce projet utilise Grinder pour simuler des données à partir de séquençage de métabarcoding et reproduire des jeux de données réels à partir de séquençage Illumina avec la plus grande fidélité. Il permet à l'utilisateur de spécifier la liste des espèces (=séquences) pour chaque échantillon, l'abondance relative des espèces dans chaque échantillon, de simuler des échantillons en plusieurs exemplaires et de simuler des erreurs de PCR et de séquençage similaires à la réalité.
Cas d'utilisation métiers
- Simulation d'échantillons et d'erreurs de PCR et de séquençage similaires à la réalité : rechercher des initiatives proches
- Reproduction de jeux de données réels à partir de séquençage Illumina : rechercher des initiatives proches
- Spécification de la liste des espèces et de leur abondance relative dans chaque échantillon : rechercher des initiatives proches
- Simulation de données de séquençage de métabarcoding : rechercher des initiatives proches
Organisation
- Centre national de la recherche scientifique (organisation rattachée)
Description générée le mardi 19 mars 2024 à 16:05:04
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