eDNA-seq Metabarcoding annotation
Pipeline bioinformatique pour l'analyse de données d'eDNA métabarcoding NGS, comprenant le démultiplexage, le filtrage, la déréplication et l'attribution de taxonomie (NCBI et taxonomie personnalisée) à l'aide d'obitools.
Cas d'utilisation métiers
- Démultiplexage de données : rechercher des initiatives proches
- Analyse de données NGS d'eDNA métabarcoding : rechercher des initiatives proches
- Attribution de taxonomie (NCBI et taxonomie personnalisée) : rechercher des initiatives proches
- Filtrage et déréplication de séquences : rechercher des initiatives proches
Organisation
- Centre national de la recherche scientifique (organisation rattachée)
Description générée le lundi 18 mars 2024 à 11:41:15
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