Mimoza
Mimoza est une bibliothèque Python permettant la visualisation et la navigation dans les modèles métaboliques. Elle représente le réseau métabolique dans un format SBML et le généralise pour détecter les métabolites et réactions similaires. Mimoza crée une carte zoomable à 3 niveaux : le niveau détaillé représente le réseau initial avec une disposition basée sur la généralisation, le niveau intermédiaire montre les versions généralisées des réactions et métabolites dans chaque compartiment, et le niveau général représente les compartiments et les réactions de transport entre eux.
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
- Analyse top-down de la structure du modèle : rechercher des initiatives proches
- Détection de métabolites et réactions similaires : rechercher des initiatives proches
- Navigation dans les réseaux métaboliques : rechercher des initiatives proches
- Visualisation de modèles métaboliques : rechercher des initiatives proches
Cas d'utilisation fonctionnel
Organisation
- Institut national de recherche en informatique et en automatique (organisation rattachée)
Description générée le mardi 19 mars 2024 à 20:49:47