only_obitools

Ce projet présente un pipeline basé sur des commandes OBITools pour éliminer les séquences interprétées comme provenant d'erreurs de PCR dans une étude d'eDNA à partir d'échantillons d'eau de aquarium.

Dépôt de code

https://gitlab.mbb.cnrs.fr/edna/exploitation/only_obitools (nouvelle fenêtre)

Cas d'utilisation métiers

Élimination de séquences interprétées comme provenant d'erreurs de PCR : rechercher des initiatives proches
Assignation taxonomique des amplicons : rechercher des initiatives proches
Analyse d'eDNA à partir d'échantillons d'eau de aquarium : rechercher des initiatives proches

Organisation

Administration centrale
- Gouvernement (Premier ministre et ministères)
  - Ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Espace
    - Établissements publics sous tutelle - Ministère chargé de l'Enseignement supérieur
      - Centre national de la recherche scientifique (organisation rattachée)

Outil utilisé

Anaconda : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi

Description générée le mardi 19 mars 2024 à 19:15:27

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