eDNA-seq Metabarcoding OTU-clustering
Pipeline bioinformatique construit avec Snakemake pour l'analyse de données NGS environnementales de métabarcoding d'ADN environnemental, y compris le démultiplexage, le filtrage et le clustering de séquences en Operational Taxonomic Unit (OTU). Il est initialement testé avec des échantillons d'ADN environnemental marin et est adapté à tout type d'organismes et d'environnements.
Cas d'utilisation métiers
- Analyse de données NGS environnementales : rechercher des initiatives proches
- Détection et suppression de chimères : rechercher des initiatives proches
- Démultiplexage et filtrage de séquences : rechercher des initiatives proches
- Clustering de séquences en Operational Taxonomic Unit (OTU) : rechercher des initiatives proches
Organisation
- Centre national de la recherche scientifique (organisation rattachée)
Description générée le mardi 19 mars 2024 à 16:59:37
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