trackmate-stardist-isbi-spt-challenge-training
Ce projet contient les scripts, le modèle et les paramètres utilisés pour entraîner un modèle StarDist sur le jeu de données du défi ISBI Grand Challenge 2014 sur le suivi de particules uniques. Les données brutes comprennent des time-lapses synthétiques de différentes particules (microtubules, vésicules) dans différentes conditions de rapport signal/bruit, ainsi que les coordonnées correspondantes des particules stockées dans des fichiers XML. Les paires image+étiquette sont utilisées pour entraîner les modèles StarDist, qui sont ensuite testés pour comparer les performances des approches basées sur StarDist et LoG dans TrackMate.
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
- Détection de particules sub-résolues dans des time-lapses synthétiques : rechercher des initiatives proches
- Comparaison des performances d'un algorithme de suivi de particules basé sur StarDist et LoG : rechercher des initiatives proches
- Génération de données d'entraînement pour un modèle StarDist : rechercher des initiatives proches
Cas d'utilisation fonctionnel
Organisation
- Ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Espace (organisation rattachée)
Description générée le dimanche 17 mars 2024 à 23:21:52
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