RNAja est un pipeline bioinformatique conçu pour analyser des données de séquençage ARN (RNAseq). Il permet d'effectuer des analyses d'expression différentielle des gènes et de générer des rapports automatisés au format Rmarkdown. Le pipeline est optimisé pour une intégration fluide avec des bases de données spécialisées comme diffexDB, facilitant ainsi la recherche en biologie moléculaire et génomique.