Ce projet permet d'identifier et de quantifier les bactéries présentes dans le microbiote de souris issues de la lignée OligoMM12, élevée dans les animaleries de l'Institut Pasteur. Il génère des fichiers de comptage, d'annotation et des visualisations interactives (Krona) pour analyser les proportions relatives des bactéries. Les données sont traitées via un workflow automatisé, disponible sur Galaxy et en ligne de commande, facilitant l'analyse métagénomique pour la recherche biomédicale.