Le projet issofa-merge est une fusion de fonctionnalités dédiées à la simulation de systèmes physiques, en particulier dans le domaine médical. Il permet de créer des simulations complexes en combinant différents algorithmes, de modifier les paramètres clés des simulations via des fichiers XML, de synthétiser des modèles complexes à partir de modèles simples, d'optimiser les dynamiques d'interactions entre objets et de comparer divers algorithmes disponibles dans SOFA.