OGRI
OGRI est un ensemble d'outils en ligne de commande écrits en Bash permettant de calculer des mesures de similarité entre génomes. Les mesures de similarité sont basées sur des alignements locaux de séquences et comprennent l'identité nucléotidique moyenne (ANI), l'identité de protéines (AAI), le pourcentage de gènes conservés (POCP) et le pourcentage d'acides aminés identiques (ProCov).
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
- Calcul de pourcentage d'identité de protéines : rechercher des initiatives proches
- Calcul de pourcentage d'identité de nucléotides : rechercher des initiatives proches
- Analyse de similarité entre génomes : rechercher des initiatives proches
- Calcul de pourcentage de gènes conservés : rechercher des initiatives proches
Organisation
- Ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Espace (organisation rattachée)
Description générée le dimanche 17 mars 2024 à 23:44:41
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