batchaif
Batchaif est un outil permettant de corriger les biais expérimentaux dans les données de séquençage monocellulaire en utilisant l'Adversarial Information Factorization (AIF). Cette méthode permet d'apprendre une distribution d'espace latent partagé entre différents lots de cellules, et de projeter les distributions de lots de cellules sur d'autres lots de cellules pour corriger les biais expérimentaux.
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
- Apprentissage de distributions d'espaces latents partagés pour des données monocellulaires
- Correction de biais expérimentaux dans les données de séquençage monocellulaire
- Projection de distributions de lots de cellules sur d'autres lots de cellules
Cas d'utilisation fonctionnel
- Utilise de l'intelligence artificielle
Organisation
- CentraleSupélec (organisation rattachée)
Outils utilisés
- scikit-image
- PyTorch
- NumPy
- scikit-learn
- Torch
- Matplotlib
- Pandas
- SciPy
Description générée le lundi 18 mars 2024 à 22:54:17
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