kb
Kb est un workflow pour le pré-traitement des données de séquençage d'ARN unicellulaire. Le pré-traitement des données de séquençage d'ARN unicellulaire implique l'association des lectures avec leurs cellules d'origine, le regroupement des lectures en fonction des identifiants moléculaires uniques (UMIs) et la génération de comptages de gènes ou de caractéristiques à partir des lectures pour générer une matrice cellule x gène.
Cas d'utilisation métiers
- Génération de matrices de comptage de gènes à partir de fichiers fastq : rechercher des initiatives proches
- Traitement de données de barcoding de caractéristiques telles que CITE-seq, REAP-seq, MULTI-seq, Clicktags et Perturb-seq : rechercher des initiatives proches
- Analyse de données de séquençage d'ARN à haut débit : rechercher des initiatives proches
- Quantification de données à partir de technologies de séquençage telles que 10x, inDrops et Dropseq : rechercher des initiatives proches
Description générée le mercredi 20 mars 2024 à 10:30:03
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