GenomAsm4pg
Notoriété 10 %
Asm4pg est un workflow automatisé et reproductible dédié à l'assemblage de génomes pour des applications pangénomiques. Il utilise des données PacBio HiFi pour produire des assemblages primaires de haute qualité. Le pipeline prend en charge plusieurs modes (HiFi, Hi-C, trio, ONT) et génère des rapports détaillés incluant des statistiques d'assemblage et des évaluations de qualité. Il est conçu pour être utilisé par des chercheurs en génomique et des bioinformaticiens.
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
- Analyse de données génomiques à haut débit : rechercher des initiatives proches
- Scaffolding de contigs chromosomiques : rechercher des initiatives proches
- Partitionnement de lectures par haplotype : rechercher des initiatives proches
- Génération de rapports d'assemblage : rechercher des initiatives proches
- Automatisation de l'assemblage de génomes : rechercher des initiatives proches
Description générée le jeudi 12 novembre 2026 à 17:04:15