nextflow_obitools

Ce projet est un pipeline bioinformatique utilisant NEXTFLOW pour l'analyse de données d'eDNA. Il est basé sur OBItools, un ensemble d'outils python conçus pour analyser les sorties de séquenceurs de nouvelle génération dans le contexte du DNA Metabarcoding.

Dépôt de code

https://gitlab.mbb.cnrs.fr/edna/nextflow_obitools (nouvelle fenêtre)

Cas d'utilisation métiers

Génération de rapports de présence environnementale d'espèces : rechercher des initiatives proches
Traitement de données de séquençage à haut débit : rechercher des initiatives proches
Analyse de données d'eDNA : rechercher des initiatives proches

Organisation

Administration centrale
- Gouvernement (Premier ministre et ministères)
  - Ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Espace
    - Établissements publics sous tutelle - Ministère chargé de l'Enseignement supérieur
      - Centre national de la recherche scientifique (organisation rattachée)

Outil utilisé

Java : voir les initiatives de ses organisations qui l'ont aussi

Description générée le mardi 19 mars 2024 à 22:36:11

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