emote-tk
EMOTE-tk est une bibliothèque R conçue pour étudier avec précision les extrémités 5' et 3' des ARN à résolution nucléotidique via des données de séquençage ciblé. Elle permet de pré-traiter les lectures FASTQ, d'aligner les séquences sur des références, de générer des tableaux de comptage des extrémités d'ARN, et d'effectuer des analyses en aval comme l'identification de sites de transcription ou l'analyse de signaux périodiques.
Cas d'utilisation métiers
- Détection de sites de transcription : rechercher des initiatives proches
- Identification de sites de clivage : rechercher des initiatives proches
- Analyse de dégradation co-traductionnelle : rechercher des initiatives proches
- Analyse des extrémités d'ARN : rechercher des initiatives proches
- Quantification de modifications post-transcriptionnelles : rechercher des initiatives proches
Description générée le jeudi 12 novembre 2026 à 16:56:38