RNAseq_quantif_pipeline
Notoriété 13 %
Ce pipeline d'analyse utilise Snakemake pour le traitement de données RNAseq et la détection de gènes différentiellement exprimés. Il prend en charge les données paired-end provenant d'un séquenceur Illumina HiSeq et utilise des outils tels que prinseq, cutadapt, STAR, HTSeq, DESeq2 et ClusterProfiler.
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
- Nettoyage et alignement de données RNAseq sur un génome de référence : rechercher des initiatives proches
- Analyse de données RNAseq pour trouver des gènes différentiellement exprimés : rechercher des initiatives proches
- Quantification et annotation fonctionnelle de gènes différentiellement exprimés : rechercher des initiatives proches
Description générée le dimanche 17 mars 2024 à 23:57:39
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