bash_vsearch_ecotag

Pipeline d'analyse de données génomiques pour l'assemblage, le démultiplexage, la déréplication avec vsearch/cutadapt et l'attribution de taxonomie avec ECOTAG.

Dépôt de code

https://gitlab.mbb.cnrs.fr/edna/bash_vsearch_ecotag (nouvelle fenêtre)

Cas d'utilisation métiers

Identification de séquences avec la base de référence ECOTAG : rechercher des initiatives proches
Analyse et traitement de données génomiques : rechercher des initiatives proches

Organisation

Administration centrale
- Gouvernement (Premier ministre et ministères)
  - Ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Espace
    - Établissements publics sous tutelle - Ministère chargé de l'Enseignement supérieur
      - Centre national de la recherche scientifique (organisation rattachée)

Description générée le dimanche 17 mars 2024 à 19:48:49

D'autres initiatives de la même organisation

cartography
github.com/riatelab/cartography
bertin
github.com/riatelab/bertin
mapsf
github.com/riatelab/mapsf
magrit
github.com/riatelab/magrit