YACO
YACO est un programme en ligne de commande écrit en Bash permettant d'orienter et d'ordonner des contigs (généralement, un assemblage de génome draft) selon une séquence de référence génomique proche. Basé sur des recherches BLAST réciproques, YACO est un outil simple et pratique qui produit généralement des résultats précis avec des temps d'exécution acceptables.
Dépôt de code
Cas d'utilisation métiers
- Recherche de fragments orthologues entre contigs et référence : rechercher des initiatives proches
- Utilisation de BLAST pour la recherche de fragments orthologues : rechercher des initiatives proches
- Utilisation d'une séquence de référence pour l'ordonnancement : rechercher des initiatives proches
- Ordre et orientation de contigs d'un projet de génome : rechercher des initiatives proches
Organisation
- Ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Espace (organisation rattachée)
Description générée le lundi 18 mars 2024 à 23:01:35
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