gatb-core
GATB-CORE est une bibliothèque C++ hautes performances et à faible empreinte mémoire dédiée à l'analyse de données de séquençage à haut débit. Elle fournit des algorithmes efficaces pour la manipulation de jeux de données de grande taille sur des ordinateurs de bureau multi-cœurs, y compris des données de séquençage provenant de n'importe quel type d'organismes, tels que des bactéries, des plantes, des animaux et même des échantillons complexes (par exemple, des métagénomes).
Cas d'utilisation métiers
- Comptage de k-mers : rechercher des initiatives proches
- Représentation de k-mers de grande taille : rechercher des initiatives proches
- Simplification de graphes pour l'assemblage : rechercher des initiatives proches
- Analyse de données de séquençage à haut débit : rechercher des initiatives proches
- Construction de graphes de débruijn : rechercher des initiatives proches
Organisation
- Institut national de recherche en informatique et en automatique (organisation rattachée)
Description générée le mardi 19 mars 2024 à 22:37:55