G3PO est un benchmark conçu pour évaluer les défis typiques rencontrés dans les projets d'annotation génomique. Il repose sur un ensemble validé de gènes eucaryotes issus de 147 organismes variés, allant de l'humain aux protistes. Le projet permet de comparer les performances de différents prédicteurs de gènes (Augustus, Genscan, GeneID, GlimmerHMM, Snap) à travers des métriques comme la sensibilité, la spécificité et le score F1, tant au niveau nucléotidique qu'exonique et protéique.