Spoon est une bibliothèque Java permettant d'analyser, transformer, transpiler et restructurer du code Java. Elle construit un AST (Arbre de Syntaxe Abstraite) bien conçu avec une API puissante pour l'analyse et la transformation. Spoon supporte les versions modernes de Java jusqu'à Java 20.

Onyxia est une application web permettant de déployer et de personnaliser des services sur un cluster Kubernetes. Elle offre un environnement de travail dédié aux data scientists et permet d'allouer des ressources spécifiques à chaque service. Onyxia intègre également des services tiers tels que S3 et Vault pour faciliter le travail avec les données et les secrets.

Moteur de transformation et de validation pour les statistiques. Trevas est un moteur Java pour le Language de Transformation et de Validation (VTL), un standard SDMX qui permet la définition formelle d'algorithmes pour valider des données statistiques et calculer des données dérivées. VTL est orienté utilisateur et fournit une vue technologiquement neutre et standard des processus statistiques au niveau métier.

Logiciel permettant l'acquisition, le contrôle et la transformation de données administratives en vue de leur utilisation statistique.

Blink is a project that allows you to simulate web browsing environments by creating virtual machines with customized fonts, plugins, and browsers. The project provides a complete source code and instructions for building your own Blink virtual machine.

OSC est une application web open source permettant le suivi des contrats et des budgets correspondants dans le contexte d'une entité de recherche. Elle est utile pour suivre chaque contrat dans le détail, pour le pilotage d'une équipe ou d'un établissement, et permet une utilisation par de multiples acteurs à plusieurs niveaux.

Le projet Parcoursup est une plateforme de gestion d'algorithmes pour l'admission dans l'enseignement supérieur en France. Il permet de calibrer des plateformes, de générer des fichiers CSV et de profiler des opérations MPI.

Sosiefier est un projet visant à explorer l'espace des variantes de programmes Java neutres, c'est-à-dire des programmes qui passent les mêmes tests que le programme d'origine. Il peut être utilisé pour explorer des sources Java, construire des transformations de code source, appliquer des transformations et exécuter des tests pour déterminer si une variante est un sosie ou non.

Queen-Back-Office est une application web Java développée avec Spring Boot, qui fournit des services de back-office pour la gestion des campagnes d'enquêtes, des questionnaires, des unités de reporting, des données d'enquête et des commentaires. Il utilise Spring Data pour l'accès aux données, Spring Security pour la sécurité, JPA pour la persistance des données, MapStruct pour le mapping objet, PostgreSQL comme base de données, JUnit et Testcontainers pour les tests automatisés, Mockito pour le mocking, RestSharp pour les appels HTTP, Swagger UI pour la documentation de l'API, Keycloak pour l'authentification et l'autorisation, Log4j pour le logging, SLF4J pour l'abstraction du logging, Apache FreeMarker pour la génération de rapports, Sonatype Nexus pour la gestion des dépendances et JSON pour le transfert de données.

La plateforme Vidjil est composée de deux parties principales : Vidjil-algo et une application web. Vidjil-algo analyse les données de séquençage à haut débit pour extraire les jonctions V(D)J et les regrouper en clones. L'application web permet la visualisation et l'analyse interactive des clones et de leur évolution dans le temps dans un contexte de suivi de la maladie résiduelle minimale ou d'étude immunologique. Elle peut également être liée à une base de données de échantillons, d'expériences et de patients pour le stockage des données et des métadonnées, l'exécution de logiciels RepSeq et la sauvegarde d'annotations directement depuis l'application web.