Spoon est une bibliothèque Java permettant d'analyser, transformer, transpiler et restructurer du code Java. Elle construit un AST (Arbre de Syntaxe Abstraite) bien conçu avec une API puissante pour l'analyse et la transformation. Spoon supporte les versions modernes de Java jusqu'à Java 20.

Ce projet vise à examiner l'impact des variations de prétraitement des données EEG sur les résultats d'analyse, en utilisant trois logiciels open-source couramment utilisés : EEGLAB, Brainstorm et FieldTrip. Les résultats montrent une bonne convergence dans le profil général des ondes cérébrales evokées (ERP), les latences de pics et les estimations de taille d'effet liées à des caractéristiques spécifiques du signal. Cependant, une variabilité considérable a été observée dans la magnitude des tensions absolues observées avec chaque logiciel, reflétée par les valeurs de similarité et les différences statistiques observées à des canaux et instants spécifiques.

Sosiefier est un projet visant à explorer l'espace des variantes de programmes Java neutres, c'est-à-dire des programmes qui passent les mêmes tests que le programme d'origine. Il peut être utilisé pour explorer des sources Java, construire des transformations de code source, appliquer des transformations et exécuter des tests pour déterminer si une variante est un sosie ou non.

PaStiX est une bibliothèque scientifique qui fournit un solveur haute performance pour des systèmes linéaires creux volumineux basé sur des méthodes directes. Les algorithmes numériques sont implémentés en simple ou double précision (réel ou complexe) en utilisant LLt, LDLt et LU avec un pivotage statique pour les matrices non symétriques ayant un motif symétrique. Cette solutionneur fournit également des méthodes de compression à faible rang pour réduire l'empreinte mémoire et/ou le temps de solution.

Logiciel d'évaluation pour les tâches d'extraction d'information. Prend en charge les tâches BioNLP-ST 2016 et BioNLP-OST 2019 SeeDev et Bacteria Biotopes. Évaluation de TAEC et EPOP à venir.

Logiciel open-source permettant de corriger, réorganiser et re-rooter des arbres géniques en fonction d'un arbre spécifique.

Ce projet gère la liste des affiliations de chaque membre de l'équipe pour garantir leur exactitude dans les publications et présentations. Il existe deux types d'affiliations pour les membres de l'équipe payés par l'Université de Lille, Centrale Lille, le CNRS ou Inria.

ASTEC est un algorithme de reconstruction 3D de blastomères à partir d'images 2D. Il permet la segmentation et le suivi d'embryons en développement, ainsi que l'analyse quantitative de la morphogenèse animale. Initialement développé pour l'étude des ascidies, il peut être appliqué à d'autres organismes.

StarPart est un framework flexible et extensible offrant une API unifiée pour manipuler des structures de graphes, hypergraphes et maillages. Il est conçu pour être facilement extensible en ajoutant de nouvelles méthodes et pour s'intégrer dans un cadre complet. Il fournit initialement des méthodes de partitionnement de graphes et d'ordonnancement de matrices creuses provenant de logiciels de pointe tels que Metis, Scotch, Patoh, Zoltan, etc. De plus, il offre des fonctionnalités pour l'E/S, le diagnostic, le banc d'essai, la visualisation (VTK, SVG, etc.)

Outil en ligne de commande permettant de gérer des projets, des machines virtuelles, des utilisateurs et des builds Jenkins sur la plateforme ci.inria.fr.