Annuaire des initiatives
Pertinence
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- Nantes Université
- Jupyter
- Notoriété 13 %Ce projet est un cours de formation sur les pratiques équitables en bioinformatique. Il est organisé en 7 notebooks Jupyter qui couvrent des sujets tels que les concepts de reproductibilité, l'utilisation de Git pour le partage de code et l'historique de fichiers, l'introduction à Conda, l'utilisation du cluster BiRD, l'introduction aux workflows Snakemake, et la description d'autres outils intéressants pour la reproductibilité.
- SingleCellClass est un projet dédié à l'analyse de données de séquençage d'ARN à l'échelle de cellules uniques. Il permet de filtrer, normaliser et réduire les dimensions de données de séquençage, ainsi que d'identifier des types cellulaires à partir de gènes marqueurs. Le projet est basé sur des notebooks Jupyter et utilise des outils tels que RISE pour une présentation interactive.
5 initiatives
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