Vitis est un outil de modélisation et de simulation dédié à l'étude de la croissance des plantes et de leur architecture. Il permet d'analyser des processus physiologiques comme l'interception de la lumière, la gestion de l'eau ou la répartition des biomasses. Utilisé en recherche agronomique et forestière, il aide à comprendre les mécanismes de développement végétal et à évaluer l'impact des conditions environnementales sur les plantes.

OpenAlea.Adel est un outil de modélisation et de simulation dédié à l'étude du développement architectural des plantes graminées. Il permet de reproduire en 3D la croissance et la morphologie des plantes, facilitant ainsi la recherche agronomique et l'analyse des interactions entre génétique et environnement. Les modèles intégrés, comme Adel-Maize et Adel-Wheat, aident à comprendre les mécanismes de développement végétal et à optimiser les pratiques culturales.

CNW-Grass est un modèle fonctionnel de structure végétale (FSPM) dédié à l'étude des graminées. Il simule la croissance des plantes en intégrant la morphogenèse, le métabolisme du carbone et de l'azote, ainsi que les flux d'eau. Le modèle prend en compte des paramètres pédoclimatiques (température, lumière, humidité, CO2, etc.) pour prédire le développement des organes végétaux, la photosynthèse, la transpiration et la sénescence. Il est utilisé en recherche agronomique pour optimiser les pratiques culturales et comprendre les interactions entre croissance végétale et environnement.

Outil open source dédié à la visualisation et l'analyse d'architectures végétales dans des environnements interactifs comme Jupyter Notebook. Il permet aux chercheurs et agronomes de modéliser, explorer et comprendre la structure des plantes en 3D, facilitant ainsi l'étude de la croissance végétale et l'analyse de données botaniques complexes.

CNW-Grass est un modèle fonctionnel structural de plante (FSPM) dédié à la simulation de la croissance des graminées. Il intègre la morphogenèse des tiges, le métabolisme du carbone et de l'azote, ainsi qu'un modèle hydraulique pour évaluer les flux d'eau dans la plante. Le projet permet d'étudier des processus comme la photosynthèse, l'élongation des feuilles, la croissance en masse des organes, et la régulation des processus métaboliques et hydrauliques. Les simulations s'appuient sur des conditions pédoclimatiques et des données initiales pour prédire le développement des plantes.

Bibliothèque Python dédiée à l'analyse des trajectoires cellulaires issues de méristèmes apicaux caulinaires (SAM). Permet aux chercheurs en biologie végétale d'étudier la dynamique de croissance des cellules pour mieux comprendre les mécanismes de développement des plantes. Facilite l'extraction et la visualisation de données complexes à partir d'images de tissus végétaux.

Ce projet permet de simuler la croissance et la morphologie des plantes, notamment des choux-fleurs et des mutants d'Arabidopsis, à partir de modèles mathématiques et de réseaux de gènes. Il offre des outils pour étudier l'impact des mutations génétiques sur la forme des plantes et reproduire des phénotypes spécifiques comme le romanesco. Les simulations sont réalisées via des logiciels dédiés et des fichiers de configuration.

Openalea.Rose est un package Python dédié à la création de rosiers virtuels en 3D. Il permet de modéliser des populations de rosiers à partir de fichiers MTG individuels pour étudier les interactions entre la structure des plantes et leur fonctionnement biologique. Les outils intégrés facilitent la reconstruction 3D et l'analyse de la croissance des rosiers dans des environnements contrôlés comme des chambres de croissance.