WAVES-core est une application web dédiée à l'intégration et à la publication d'outils bioinformatiques en ligne. Elle permet aux chercheurs et scientifiques de présenter, publier et donner accès à leurs services bioinformatiques via une interface web conviviale. L'application facilite la gestion des accès utilisateurs, l'exécution des outils sur différentes plateformes (Galaxy, clusters DRMAA, scripts directs, etc.) et l'interaction avec des API REST distantes.

BioWeb est une plateforme dédiée à la gestion et au catalogage de ressources bioinformatiques. Elle permet aux chercheurs, institutions et professionnels de la biologie de référencer, organiser et partager des outils, logiciels et bases de données spécialisés dans le domaine de la bioinformatique. L'objectif est de faciliter l'accès à ces ressources et d'améliorer la collaboration entre les acteurs du secteur.

Ce projet propose une interface web pour interagir avec le service SIWAA, permettant aux utilisateurs de soumettre des simulations bioinformatiques, de suivre l'état des jobs en cours et de récupérer les résultats. Il facilite l'accès à des outils de calcul scientifique sans nécessiter de compétences techniques avancées, en s'appuyant sur des technologies comme Flask et R pour l'exécution des workflows.

Ce service propose un serveur RStudio accessible via navigateur web, dédié à l'analyse bioinformatique et au calcul statistique. Il permet aux utilisateurs de déployer leur propre instance R avec des packages standards et des outils de visualisation intégrés. L'environnement est personnalisable via des fichiers de configuration ou des dépôts Git, et peut être adapté pour des besoins spécifiques en bioinformatique ou en intelligence artificielle.

Projet dédié à la création et à la diffusion d'outils bioinformatiques pour l'analyse de données biologiques. Il facilite le développement de pipelines d'analyse, la visualisation de résultats et la collaboration entre chercheurs. Les solutions proposées visent à accélérer la recherche en biologie et en génomique, en rendant les outils accessibles et réutilisables.

Ce projet permet de déployer des serveurs Galaxy personnalisés sur l'infrastructure cloud de l'IFB (Institut Français de Bioinformatique). Il offre un environnement accessible et reproductible pour la recherche computationnelle en bioinformatique, incluant des outils et des banques de données adaptables. Les utilisateurs peuvent configurer leur instance Galaxy selon leurs besoins spécifiques, que ce soit via Docker ou Ansible.

Le projet Biosphere Galaxy App permet de déployer des serveurs Galaxy personnalisés sur l'infrastructure cloud de l'IFB. Il offre un environnement dédié à la recherche computationnelle accessible, reproductible et transparente, incluant des outils bioinformatiques et des bases de données biologiques. Les utilisateurs peuvent configurer leur instance Galaxy selon leurs besoins en choisissant des versions spécifiques, des outils et des banques de données.

Le projet Biosphere Galaxy App permet de déployer des serveurs Galaxy personnalisés sur l'infrastructure cloud de l'IFB. Il offre un environnement de calcul bioinformatique ouvert, reproductible et transparent, accessible via une interface web. Les utilisateurs peuvent configurer leur instance Galaxy avec des piles logicielles spécifiques, des banques de données et des outils adaptés à leurs besoins de recherche. L'outil facilite la collaboration et le partage de données dans le domaine de la biologie computationnelle.

Environnement de recherche virtuel dédié à l'identification et à l'analyse des répétitions et éléments transposables dans les génomes. Ce projet permet aux chercheurs en bioinformatique et génomique de traiter des données génomiques complexes pour découvrir des motifs répétitifs et mieux comprendre la structure des génomes. Il s'appuie sur des outils spécialisés et des bases de données publiques pour offrir une solution collaborative et accessible.

Orthofinder2JSON-Graph est un outil spécialisé dans la conversion des résultats d'Orthofinder au format JSON, optimisé pour une visualisation sous forme de graphes. Il transforme les données d'orthologie en structures accessibles, facilitant ainsi l'interprétation des relations entre protéines et espèces. Ce projet s'adresse principalement aux chercheurs en bioinformatique et en biologie évolutive souhaitant analyser et visualiser des ensembles de gènes orthologues.