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Pertinence
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- Pggb est un pipeline de construction de graphes pangénomiques qui transforme des collections de séquences génomiques en graphes de pangenome. Il permet de modéliser les variations génétiques entre individus, facilitant ainsi l'analyse comparative et la visualisation des données génomiques. Utilisé principalement en bioinformatique, il aide les chercheurs à comprendre les structures génomiques complexes et à identifier des variations pertinentes pour des applications médicales ou agronomiques.
- Outil d'aide à la création de hubs colorés à partir des résultats de chromHMM. Permet aux chercheurs en bioinformatique de visualiser et analyser les données de segmentation chromatinienne de manière automatisée et reproductible. Facilite l'interprétation des modèles de Markov cachés appliqués à la génomique.
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