Ce projet propose des utilitaires pour analyser l'usage des codons dans les séquences génétiques. Il permet aux chercheurs en bioinformatique d'étudier les biais de codons, d'optimiser des séquences pour l'expression génique ou de comparer des profils de codons entre différentes espèces. Les outils développés facilitent l'analyse statistique et visuelle des données génomiques.

Ce projet permet d'analyser et de comparer l'usage des codons génétiques entre différentes espèces bactériennes, notamment *Vibrio cholerae* et *Escherichia coli*. Il calcule les biais de codon, filtre les gènes, classe les gènes en clusters selon leurs biais, et extrait des listes de gènes pour des analyses approfondies. Les résultats sont utilisés pour étudier les préférences codoniques et leur impact sur l'expression génique.

Ateliers Codons est une plateforme dédiée à la visualisation et l'analyse de données biologiques. Elle permet aux utilisateurs de proposer des jeux de données pour des défis de visualisation, de partager les résultats de leurs analyses et de collaborer sur des projets de recherche.

Outil bioinformatique conçu pour identifier et traduire les cadres de lecture ouverts (ORF) dans des séquences nucléotidiques. Il permet de maximiser la traduction des régions non-stop d'un génome tout en minimisant le chevauchement des ORF. Utilisable sur tout type de génomes (bactéries, virus, eucaryotes), il facilite les analyses comparatives de séquences génétiques via des comparaisons de codons ou d'acides aminés.