Annuaire des initiatives
Pertinence
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- PlanarLarvae.jl est un package Julia dédié à l'analyse de mouvements larvaires. Il permet de lire et de traiter des fichiers de suivi de larves générés par différents programmes, tels que Choreography, FIMTrack et JBM's automatic tagger. Le package fournit des types de données de base pour les descriptions 2D de la larve, ainsi que des fonctionnalités de base pour les étiquettes discrètes de comportement, y compris le support pour les fichiers d'étiquettes JSON.
- Track Analyzer est une pipeline Python de visualisation et d'analyse de données de suivi d'objets. Il ne réalise pas de suivi d'objets, mais permet de visualiser et de quantifier tout type de données de suivi. Il analyse les trajectoires en calculant des grandeurs telles que la vitesse, l'accélération, le coefficient de diffusion, la densité locale, etc. Les trajectoires peuvent être représentées sur l'image d'origine en 2D ou 3D en utilisant un codage de couleur personnalisé.
- BioFlow est un plugin pour le logiciel d'analyse d'images bio médicales Icy, développé par des membres ou anciens membres de l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur. Il permet de mesurer les vitesses, la pression et les forces à l'intérieur des cellules en utilisant des données de microscopie vidéo 2D ou 3D.
- Track Painter est un plugin pour le logiciel d'analyse d'images bio Icy, développé par des membres ou anciens membres de l'unité d'analyse d'images biologiques de l'Institut Pasteur. Il permet d'afficher les trajectoires disponibles sur une séquence donnée dans des vues 2D et 3D, avec diverses options de visualisation.
- CometeSwt est un logiciel permettant l'affichage et l'analyse de données sous forme de tableaux et de graphiques. Il offre des fonctionnalités avancées de gestion de masques et de régions d'intérêt (ROI), ainsi que la manipulation de données 1D et 2D. L'utilisateur peut personnaliser l'apparence des graphiques selon ses besoins.
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