Outil bioinformatique conçu pour identifier la liaison au sexe dans des données de séquençage haut débit issues de croisements contrôlés. Il permet aux chercheurs d'analyser les données génomiques des parents et de leur descendance afin de détecter des régions génétiques liées au sexe. Ce projet facilite les études en génétique et en biologie évolutive.

Plateforme dédiée à l'analyse et à la visualisation de données génomiques et biologiques. Elle permet aux chercheurs de collaborer, d'explorer des réseaux d'opérons et de protéines, et de publier leurs résultats sous forme de visualisations interactives. Intégrée à des outils bioinformatiques, elle facilite la compréhension des interactions moléculaires et la génération de rapports scientifiques.

DExTER est un outil bioinformatique conçu pour analyser des séquences génomiques et des données d'expression génique. Il permet d'identifier des régions génomiques pertinentes (k-mers) associées à des conditions biologiques spécifiques. Le logiciel génère des modèles prédictifs pour comprendre les liens entre les séquences et l'expression des gènes, facilitant ainsi la recherche en biologie moléculaire et en génomique fonctionnelle.

Ce projet propose une suite de notebooks Jupyter dédiés à l'analyse et la visualisation de données génomiques 3D issues de fichiers Hi-C. Il permet aux chercheurs en biologie moléculaire d'explorer les interactions chromosomiques et de générer des visualisations pour leurs études. Les outils sont conçus pour être utilisés dans un cadre académique ou institutionnel, facilitant la collaboration et l'interprétation des données.

Outil dédié à l'analyse de données de séquençage ARN à haut débit (RNA-seq) pour identifier les gènes dont l'expression est modifiée entre différentes conditions biologiques. Permet aux chercheurs en biologie computationnelle et en génomique de traiter des tableaux d'expression génique, de générer des visualisations statistiques et de produire des rapports automatisés pour faciliter l'interprétation des résultats expérimentaux.

Outil dédié à l'analyse et au traitement de données biologiques et génomiques. Permet aux chercheurs et biologistes de manipuler des fichiers de séquençage, automatiser des pipelines bioinformatiques et générer des rapports détaillés. Facilite l'interprétation des données génomiques pour des applications en recherche médicale ou agronomique.

Ce projet permet de reproduire des expériences visant à détecter des réinitialisations dans les réseaux de régulation génique à partir de données d'expression génique unicellulaire. Il fournit des outils pour analyser des jeux de données biologiques et générer des visualisations associées, facilitant ainsi la recherche en biologie computationnelle et en génomique.

Slitherine est un outil bioinformatique conçu pour identifier et analyser les différences significatives entre deux matrices de contact génomique. Il permet de comparer des données issues de séquençage haut débit, comme celles obtenues lors d'expériences de conformation chromosomique, afin de mettre en évidence des variations entre conditions biologiques. L'outil génère des rapports détaillés, des visualisations graphiques et des fichiers de résultats exploitables pour la recherche en génomique.

Bioviz-js est une bibliothèque JavaScript dédiée à la visualisation de données biologiques complexes. Elle permet aux chercheurs et biologistes de représenter des génomes, des cladogrammes, des QTL et d'autres données génétiques sous forme de graphiques interactifs. L'outil facilite l'analyse et l'interprétation des données pour des applications en génomique, phylogénie et biologie moléculaire.

Application de bureau dédiée à l'analyse de données de cellules uniques, permettant aux chercheurs et biologistes de traiter, visualiser et interpréter des résultats expérimentaux complexes. L'outil facilite l'exploration de données génomiques et biomédicales pour accélérer les découvertes scientifiques dans des domaines comme la génomique ou la biologie cellulaire.