MassChroQ est un logiciel dédié à l'analyse de données protéomiques issues de la spectrométrie de masse. Il permet la quantification et l'alignement de données massives, offrant ainsi une gestion efficace de ces dernières et une analyse poussée.

LILAMS (Leucine Isotopic Labeling Analysis by MS) est un projet logiciel développé à l'Institut Pasteur pour analyser quantitativement les résultats de spectrométrie de masse sur des protéines marquées avec des acides aminés lourds. Il permet de traiter des données issues d'expériences SILAC-TAP, d'extraire des pics d'intérêt dans les spectres, et de générer des rapports structurés au format XML pour une analyse approfondie des protéines identifiées.

Ce projet permet le traitement et l'analyse de données issues de spectromètres de masse PTR-MS (Proton Transfer Reaction Mass Spectrometry). Il facilite la visualisation des résultats pour les chercheurs et les ingénieurs en sciences de l'atmosphère. Les données traitées proviennent d'expériences menées dans des environnements contrôlés ou naturels, contribuant à des études environnementales ou climatiques.

SPIKE est une bibliothèque open source dédiée au traitement, à l'analyse et à la visualisation de données issues de spectroscopies par transformée de Fourier. Elle permet de manipuler des spectres 1D et 2D, principalement en résonance magnétique nucléaire (NMR) et en spectrométrie de masse (FT-ICR-MS, Orbitrap). L'outil intègre des fonctionnalités avancées comme la correction de ligne de base, la réduction de bruit, la détection de pics et la transformation de Fourier, offrant une solution complète pour les chercheurs en chimie analytique et en spectroscopie.

Ce projet est une fonction R conçue pour améliorer la précision des données issues de spectromètres de masse LC-MS/MS. Il permet de fusionner les données MS1 et MS2 d'un fichier .CDF avec un fichier .mzXML, en remplaçant les spectres de masse convertis par des données plus précises issues du format natif .CDF. Cela évite les décalages de masse observés avec d'autres outils de conversion, garantissant une meilleure fiabilité pour des applications comme la dereplication ou l'analyse de réseaux moléculaires.

Outil dédié à l'analyse et à la visualisation simplifiée des données issues d'expériences TGMS (Thermogravimétrie et Spectrométrie de Masse). Il permet aux chercheurs de gagner du temps dans le traitement des données brutes, en générant des graphiques clairs et en facilitant l'exportation des résultats pour des rapports ou publications scientifiques.

I2masschroq est un logiciel dédié à la quantification de protéines et à l'analyse de spectrométrie de masse. Il permet le traitement de données de protéomique et la gestion de données de spectrométrie de masse. Il est distribué sous la licence GNU General Public License.

Logiciel dédié à l'analyse rapide de données issues de spectromètres de masse PTR-ToF-MS. Il permet d'importer, visualiser et traiter des spectres de composés organiques volatils (COV) en quelques minutes. Le projet automatise la détection des pics et génère des matrices de données prêtes pour des analyses chimométriques avancées, facilitant ainsi l'interprétation des résultats pour les chercheurs et industriels.

Outil dédié à la déconvolution de données issues de spectromètres de masse haute résolution Brüker. Il permet de traiter des fichiers au format .xy pour extraire des informations précises et fiables à partir de spectres complexes. Utilisé principalement dans le domaine de la recherche scientifique et analytique, il facilite l'analyse automatisée et la génération de rapports interprétables.

Bibliothèque Python dédiée au traitement et à l'analyse de données issues de spectromètres de masse à réaction par transfert de protons (PTR-MS). Elle permet de traiter les données du SIRTA (Site Instrumental de Recherche par Télédétection Atmosphérique) pour en extraire des informations sur la composition chimique de l'atmosphère. Le projet inclut des outils de calibration, de correction temporelle et de visualisation pour faciliter l'interprétation des résultats.