Annuaire des initiatives
Pertinence
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- Le projet seascape_course_cloud est une plateforme d'analyse de données génomiques marines. Il permet aux utilisateurs de traiter et d'analyser des données de séquençage à haut débit pour détecter des structures populationnelles chez les organismes marins et construire des cartes génétiques pour l'étude des paysages.
- Le package R VarExp fournit des fonctions pour l'estimation de la variance phénotypique expliquée par des effets génétiques, interactionnels ou conjointement par ces deux effets. Ces fonctions sont utiles pour les designs de méta-analyse où la mise en commun des données génétiques individuelles est difficile.
- Beast est un outil d'analyse de données génétiques permettant d'inférer la taille de population au fil du temps et la dynamique démographique des populations. Il prend en entrée des fichiers de données génétiques et produit des visualisations et des résultats d'inférence sous forme de fichiers de sortie.
- Ce projet est une application web développée avec Shiny, un framework pour R, permettant de visualiser et d'analyser des données sur la diversité génétique des poissons marins. Il offre une cartographie interactive de la répartition des espèces de poissons et permet de réaliser des analyses approfondies sur ces données.
- Le package R 'sameStrain' est un outil dédié à l'analyse et à la simulation de données génétiques de bactéries. Il permet de calculer des statistiques sur les données, de simuler des événements de mutation et de recombinaison, et de visualiser les résultats grâce à des graphiques générés avec ggplot2.
- Le projet gattlab est une plateforme dédiée à l'analyse de données génomiques. Il permet la recherche de variations génétiques, le développement d'outils de bio-informatique et la gestion de workflows de génomique. Il offre des fonctionnalités avancées pour les chercheurs et professionnels du domaine de la génomique.
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