Annuaire des initiatives
Pertinence
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- Outil dédié à l'analyse et au traitement de données taxonomiques virales issues de résultats BLAST et de tables de comptage. Il permet de filtrer, regrouper et fusionner des données pour préparer des analyses en aval comme la visualisation ou les tests statistiques. Basé sur des algorithmes de propagation de labels et de clustering, il identifie des groupes de contigs viraux partageant des profils similaires.
- Projet dédié à la traduction et au regroupement de séquences nucléiques de la base de données RVDB. Il permet d'analyser et de structurer des données génomiques virales pour faciliter la recherche en virologie. Les outils développés automatisent des pipelines complexes pour traiter des versions successives de la base RVDB, en intégrant des métadonnées et des références taxonomiques.
- Virus Pop est un outil conçu pour générer des séquences protéiques virales réalistes à partir d'un groupe taxonomique spécifié en entrée. Il permet aux chercheurs en virologie de créer des jeux de données simulés pour étudier l'évolution des virus, valider des méthodes d'analyse ou visualiser des arbres phylogénétiques. L'outil facilite la modélisation de scénarios évolutifs et l'exploration de données génomiques sans nécessiter de séquences réelles.
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