Outil en ligne de commande conçu pour analyser des fichiers GFF3 et leurs séquences associées au format FASTA. Il génère des statistiques détaillées sur les annotations génomiques, comme le contenu en GC, les sous-séquences ou les informations de positionnement. Utilisé principalement par des chercheurs en bioinformatique pour évaluer la qualité et les caractéristiques des données génomiques.

Outil permettant d'identifier et de valider automatiquement les formats de fichiers utilisés en bioinformatique et génomique. Il analyse des fichiers comme FASTA, GFF3, BED, VCF ou BAM pour en déterminer la structure, détecter les erreurs et fournir des métadonnées essentielles à leur exploitation. Utilisé par les chercheurs et laboratoires pour garantir l'intégrité et la compatibilité des données avant analyse.

PanTEannot est un outil bioinformatique conçu pour annoter de manière sérielle les éléments transposables (TE) dans plusieurs assemblages de génomes complets à partir d'une bibliothèque de référence commune. Il se concentre sur les séquences non dégénérées, comme les copies complètes de TE, pour étudier la variabilité récente entre individus. Les fichiers d'annotation générés (au format Gff3) peuvent ensuite être utilisés comme entrée pour d'autres outils d'analyse génomique.