RANOMALY est un package R dédié à l'analyse de la diversité microbienne. Il permet de traiter et d'interpréter des données issues de séquençage à haut débit, en particulier pour les gènes 16S et ITS. Il intègre des méthodes statistiques avancées et des algorithmes d'apprentissage automatique pour détecter et caractériser les espèces microbiennes présentes dans un échantillon.

Dépôt de code source pour l'analyse de gènes 16S utilisant les bibliothèques phyloseq et ACP dans R. Il contient des exemples de scripts pour l'importation et l'analyse de données, ainsi que des données d'exemple au format biom, xlsx, fasta et txt.

BIOCOM-PIPE est un pipeline d'analyse de séquences d'ADN microbien dans un environnement Docker. Il permet l'alignement et la classification de séquences à partir des gènes 16S, 18S et 23S. Il inclut tous les outils nécessaires à son fonctionnement et télécharge automatiquement les bases de données utilisées.

Ce projet combine les fonctionnalités de dada2 et FROGS pour analyser des données génomiques, identifier des espèces à partir de séquences d'ADN et générer des rapports sur la composition des échantillons. Il est capable de traiter les données 16S et ITS.