Ce projet vise à analyser et à comprendre la diversité et l'activité des communautés microbiennes marines à partir de l'étude de génomes bactériens et archéens. Il comprend la reconstruction de réseaux métaboliques, l'étude de la diversité et de l'activité des communautés, ainsi que la modélisation de l'impact des facteurs biotiques sur la structure de ces communautés.

Ce projet vise à analyser des séquences génomiques de micro-organismes à l'aide de méthodes de métabarcoding haute fidélité. Il permet d'identifier les taxons bactériens présents dans un échantillon et d'étudier la diversité microbienne. Le projet est basé sur l'utilisation de l'outil FROGS et de méthodes d'analyse statistique.

IKISS est un projet d'analyse de génomes bactériens permettant l'identification de souches et la détection de mutations sous sélection. Il s'appuie sur des méthodes bioinformatiques avancées pour fournir une analyse précise et fiable des données de séquençage.

Quast est un outil d'analyse de l'assemblage de génomes, permettant d'évaluer la qualité et la précision des assemblages, de détecter les variations génétiques et de comparer différentes souches bactériennes.

BIOCOM-PIPE est une pipeline d'analyse de métagénomique conçue pour caractériser les communautés microbiennes et étudier la diversité microbienne dans différents écosystèmes. Elle permet la reconstruction de génomes bactériens et fournit une analyse approfondie des données de séquençage.

Salin est un outil d'analyse de génomes bactériens permettant la détection de cassettes integron et la génération de séquences avec cassette integron spécifique.