Annuaire des initiatives

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  • Outil d'analyse bioimage dédié à l'étude des mouvements cellulaires ou d'objets biologiques. Il permet de mesurer et comparer des statistiques de déplacement (minimal, maximal, moyen, total) ainsi que des profils de déplacement le long des axes spatiaux. Utilisé pour quantifier la motilité cellulaire dans des images 2D ou 3D, il s'intègre comme un plugin au logiciel Icy, une plateforme open source d'analyse d'images biologiques développée à l'Institut Pasteur.
  • Notoriété 7 %
    Outil dédié à la création de kymographes pour analyser les mouvements de régions d'intérêt dans des séquences d'images, notamment dans le cadre de l'étude du développement biologique. Il permet de tracer des rectangles sur des images ou vidéos, puis de générer une représentation graphique de l'évolution temporelle de l'intensité lumineuse le long d'un axe. Utilisé principalement en recherche biomédicale pour visualiser des dynamiques cellulaires ou moléculaires.
  • Notoriété 7 %
    Outil de segmentation automatique pour l'analyse d'images biologiques, spécialisé dans la détection des contours de noyaux ou de cellules à partir d'une région d'intérêt approximative. Permet l'étude de la morphodynamique cellulaire et le suivi de cellules en mouvement lent. Compatible avec les images 2D et 3D, il s'intègre comme un plugin dans le logiciel Icy, dédié à l'analyse d'images bio-médicales.
  • Plugin pour le logiciel Icy dédié à l'analyse d'images biologiques. Il permet de traiter et d'analyser les trajectoires d'objets (comme des cellules ou des particules) dans des séquences d'images microscopiques. L'outil facilite l'extraction de régions d'intérêt (ROI) et l'application de filtres pour affiner les données avant leur analyse quantitative. Utilisé principalement en recherche biomédicale pour étudier les mouvements cellulaires ou moléculaires.
  • Plugin pour le logiciel Icy dédié à l'analyse d'images biologiques. Il permet de créer des protocoles pour le suivi de spots (particules) dans des séquences d'images, facilitant l'estimation, la sauvegarde et l'ajustement des paramètres de suivi. Utilisé principalement en recherche biomédicale pour étudier le mouvement de molécules ou de structures cellulaires.
  • Plugin pour le logiciel d'analyse d'images biologiques Icy, conçu pour traiter et analyser les trajectoires d'objets dans des séquences d'images microscopiques. Il permet de détecter, comparer et visualiser des mouvements cellulaires ou moléculaires, facilitant ainsi l'étude des dynamiques biologiques. Utilisé principalement en recherche biomédicale et en biologie cellulaire.

6 initiatives